Arcángel Rafael (Retablo Mayor Iglesia de San Miguel)
En la Cartuja se encuentra también una escultura de San Bruno, que realizó hacia 1637. Continuó su obra en Jerez para la iglesia de San Miguel , cuando Juan Martínez Montañes en 1641 le traspasó parte del retablo mayor. Este retablo consta con cuatro relieves de las entrecalles: La Encarnación, La Adoración de los Patores, La Circuncisión y la Adoración de los Reyes Magos, y cuatro figuras: los arcángeles Gabriel y Rafael y los santos Juan el Bautista y Juan el Evangelista. Mientras duró este trabajo, José de Arce vivió en Jerez, en la collación de dicha parroquia. Se casó también en San Miguel, con Margarita de Meneses.
En estas fechas realizó encargos en otras iglesias ; el Crucificado de la Salud, de la iglesia de San Miguel y el de la Catedral (hacia 1641); en la iglesia de San Dionisio las imágenes de San Bartolomé, un Niño Jesús y San Juanito (hacia 1641), y en San Marcos otra talla de San Juanito (hacia 1650).
En 1650, ya en Cádiz, concertó otro retablo, concretamente las esculturas del retablo mayor de la iglesia de la Merced y en 1651 en el convento de San Agustín, donde trabajó junto con Jacinto Pimentel.